微信办理ETC时，需要支付99元的费用，可能是由于以下原因：
1. 设备成本：办理ETC时需要购买一个车载电子标签（OBU）。这个设备的价格可能在50-100元左右，所以99元的价格可能包含了设备的费用。
2. 安装服务：部分地区的微信办理ETC服务可能会提供安装服务，这也会产生一定的费用。
3. 技术服务费：办理ETC的过程中，可能需要经过技术人员的审核、激活等工作，这部分工作可能会产生一定的技术服务费。
4. 优惠策略：一些地区或银行可能会推出办理ETC的优惠活动，99元的价格可能是为了吸引用户的一种优惠策略。
具体情况还需要根据您所在地区的具体政策来判断。建议您在办理前与相关部门进行咨询了解。
