C1驾驶证在试用期内如果被扣6分，一般来说并不会对转正产生直接影响。但是，需要注意的是，实习期内的驾驶员违章扣分可能会影响到其驾驶证的年审和后续的驾驶资格。
根据《机动车驾驶证申领和使用规定》，持有C1驾驶证的驾驶员在实习期内有记满12分记录的，注销其实习的准驾车型驾驶资格。也就是说，如果在实习期内被扣满12分，那么你的C1驾照就会被吊销。
此外，实习期结束后，如果你的驾驶证累计记分达到12分的，也会注销其实习的准驾车型驾驶资格。所以，虽然实习期扣6分不会影响转正，但还是要尽量避免违章行为，确保自己的行车安全。