保险公司在理赔时，需要被保险人签署一份赔偿协议。如果双方对赔偿金额达成一致意见，但对方拒绝签字，这并不影响保险公司的赔付责任。
一般来说，保险公司会根据交警出具的责任认定书来确定赔偿比例。如果是主责和次责的情况，保险公司会按照一定的比例进行赔付。例如，主责方承担70%的赔偿责任，次责方承担30%的赔偿责任。
当双方就赔偿金额无法达成一致意见时，可以寻求第三方调解或仲裁机构的帮助。如果调解无果，任何一方都可以向法院提起诉讼。
总之，即使对方不签字，只要事故责任明确且符合保险合同条款，保险公司仍然有义务履行其赔付责任。