当公司的车辆被撞，对方负全责时，保险公司会按照以下步骤进行理赔：
1. 确认责任归属：首先需要交警出具交通事故认定书，明确对方承担全部责任。
2. 通知保险公司：联系对方的保险公司，报告事故并索取相关理赔表格。同时，也要通知自己的保险公司，以便记录备案。
3. 准备材料：根据保险公司的要求，提供相关的证明材料，如车辆的行驶证、驾驶执照、交通事故认定书等。如果车辆受损严重，可能需要拍照留存证据。
4. 评估损失：保险公司会对车辆进行定损，确定修理费用或更换零部件的费用。
5. 修理车辆：将车辆送到修理厂进行修复。
6. 提交索赔申请：向对方的保险公司提交索赔申请，并提供相关材料。如果对方拒绝赔偿，可以请求自己的保险公司代为追讨。
7. 领取赔款：在修理完成后，保险公司会根据定损金额支付赔款。赔款通常会直接支付给修理厂，或者支付给公司账户用于支付修理费用。
8. 保留发票和维修清单：在收到赔款后，要保留修车发票和维修清单，以备日后查账。
整个理赔过程可能需要一段时间，具体进度可以根据与保险公司的沟通情况了解。在整个过程中，保持与保险公司的良好沟通是非常重要的。