是的，可以。
在北京，如果你的摩托车合格证丢失了，你可以按照以下步骤进行补办：
1. 首先，你需要到购买摩托车的经销商处开具一张证明，证明你的摩托车确实是从他们那里购买的，并且合格证确实曾经发放过。
2. 然后，带着这张证明和你的个人身份证（原件+复印件）以及购车发票（原件+复印件）去你所在地区的车辆管理所申请补办。
3. 在车管所，工作人员会核实你的信息并查看你的证明和购车发票等文件。确认无误后，他们会为你办理合格证补办手续。
4. 根据规定，补办摩托车合格证需要缴纳一定的工本费。缴费完成后，你就可以等待新的合格证制作完成了。一般来说，这个过程可能需要几天的时间。
5. 合格证制作完成后，车管所会通过邮寄的方式将新证寄给你。请注意查收。
以上就是北京市摩托车合格证补办的流程。请注意，不同地区可能会有一些差异，所以建议你在实际操作前先联系当地的车管所进行咨询。