整车过线但是停住了算闯红灯吗怎么处理

不算。
根据《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》中的相关规定，只有当车辆完全越过停车线后继续行驶并通过路口的整个过程才被视为闯红灯行为。如果车辆在越过停车线后停止行驶并未继续通过路口，那么这并不属于闯红灯的行为。
至于如何处理，如果你担心被电子警察记录或者被其他司机投诉，你可以去当地的交通队查询并申请撤销处罚。不过，需要注意的是，这种操作可能会比较麻烦，因为需要提供相应的证据来证明你的情况不属于闯红灯。