当您的汽车因涉水行驶或被水淹导致发动机损坏时，您可以按照以下步骤向保险公司申请赔偿：
1. 立即报警：在发现汽车被淹后，您应立即拨打报警电话寻求帮助。这将有助于记录事故发生的时间和地点，以便于后续保险理赔。
2. 拍照留证：在可能的情况下，拍摄现场照片以保留证据。这些照片应包括汽车周围的水位线、车辆损坏情况以及涉及的道路或地区标志。
3. 联系保险公司：尽快联系您的保险公司报告事故。向他们提供详细信息，如车牌号、事故发生时间、地点和水深等。
4. 了解保险条款：仔细阅读您的保险合同，了解关于涉水险的相关条款和赔付标准。这将帮助您了解保险公司需要承担的费用范围。
5. 评估损失：在保险公司到达现场进行评估之前，确保您已经关闭了引擎并断开电池连接，以防止进一步损坏。等待保险公司评估员对车辆进行检查和估价。
6. 提交索赔：根据保险公司的建议，提交索赔申请。提供相关证据和图片，以便于保险公司核实事故经过和处理赔偿事宜。
7. 领取赔偿：一旦保险公司批准了您的索赔申请，您将按照合同约定获得相应的赔偿。这可能包括车辆修理费用、发动机更换费用以及其他相关支出。
请注意，具体的赔偿金额将取决于您的保险合同条款、车辆损坏程度以及评估员的意见。在处理保险理赔时，保持与保险公司的良好沟通至关重要。