要查询深圳小区的车位是否属于人防工程，可以采取以下几种方式：
1. 询问物业：物业部门通常会对小区内的设施有详细的了解，可以直接向物业咨询车位的人防情况。
2. 查看车位合同：如果购买了车位，可以在合同中查看车位的性质和用途，看是否属于人防工程。
3. 查阅相关资料：可以向开发商或相关部门查阅相关的设计图纸、规划许可证等资料，以确认车位的人防属性。
4. 联系当地人防办：人防办是负责人民防空工作的政府职能部门，可以向深圳市人防办咨询具体车位的人防信息。
5. 现场考察：如果条件允许，可以去实地观察车位的位置、结构和设施等，与人防工程的特征进行对比判断。