扬州市区对摩托车进行限制，具体规定如下：
1. 市区禁行区域：东至京杭大运河、南至328国道（不含）、西至宁通高速公路（不含）、北至文昌路（含）的范围内，全天24小时禁止摩托车通行。
2. 市区限行区域：东至扬子江北路、南至328国道（不含）、西至宁通高速公路（不含）、北至文昌路（含）的范围内，每日7:00至9:00、16:00至18:00禁止摩托车通行。
违反上述规定的，由公安机关交通管理部门依照道路交通安全法律、法规的规定进行处罚。
具体的处罚措施包括罚款和扣车等。具体的金额可能会根据具体情况有所不同。建议遵守当地的交通规则。