如果你的电动车的合格证丢失了，你需要采取以下步骤来处理：
1. 首先，联系销售商或制造商。他们可能能够提供一份证书的副本或者重新发放一份新的证书给你。
2. 如果无法获得新的证书，你可以尝试去当地的车辆管理局咨询一下。有些地区允许车主提供购车发票、产品说明书等证明车辆合法来源的材料来进行上牌申请。但是，每个地区的政策可能会有所不同，所以最好还是先电话咨询清楚。
3. 在上牌过程中，如果工作人员要求你出示合格证，你可以尝试提供其他证明材料，如购车发票、产品说明书等，以证明你的电动车是合法的。同时，保持礼貌和耐心，因为每个地方的政策和处理方式可能会有所不同。
4. 最后，如果你实在无法取得合格证，可以考虑购买一辆新的电动车。在购买新电动车时，务必向销售商索要所有必要的文件，并妥善保存以备日后可能需要时使用。