更换发动机涉及到车辆登记证的变更，所以需要办理以下手续：
1. 首先到车管所进行备案。提交申请和填写相关表格，说明你的车更换了发动机的原因（如故障、事故等）以及新发动机的相关信息（型号、生产商等）。
2. 提供新发动机的合格证和相关技术参数资料。
3. 提供车辆的原始档案，包括购车发票、出厂合格证明、注册登记证等。
4. 经过车管所审查批准后，将车辆登记信息中的发动机信息更改为新发动机的信息。同时，你需要重新拍摄车辆的正面、侧面、尾部照片，以证明车辆的外观与登记时一致。
5. 缴纳一定的工本费后，新的发动机注册登记表和车辆登记信息将盖章生效。
6. 最后，你还需要到保险公司办理保单批改手续，因为更换发动机可能会影响你的车辆保险条款。
以上是一般情况下的流程，具体细节可能因地区而异，建议提前咨询当地的车管所或保险公司了解具体要求。