如果你已经成功取消了深圳小汽车摇号申请，但发现你的号码已经被注册过了，你可以尝试以下方法：
1. 联系深圳市小汽车指标调控系统客服。向他们说明情况，看看是否有解决方案。他们的联系方式可以在官方网站上找到。
2. 如果你的号码被注册是因为有人冒用你的信息，你可以向公安部门报案。提供你申请摇号的记录和号码被注册的记录，让他们调查并解决问题。
3. 在官方平台上查看你的申请记录，确保没有重复申请的情况。如果有重复申请，取消其中一个申请即可。
4. 等待一段时间后再尝试申请。有时候系统问题可能会导致申请记录丢失或延迟显示。
5. 如果以上方法都无法解决问题，可以考虑咨询律师或者相关部门寻求帮助。