在深圳办理通行证，需要按照以下步骤操作：
1. 准备所需材料：身份证、户口本、深圳市居住证（非深户）或深圳户籍证明。
2. 登录广东政务服务网或者深圳市公安局官网，填写《广东省居住证通行证申请表》并预约办理时间。
3. 按照预约时间前往办证大厅，提交申请材料。工作人员会对材料进行审核，审核通过后，现场采集指纹和照片。
4. 缴费：根据选择的通行证类型（普通证或加急证）缴纳相应的费用。
5. 领取通行证：在规定的时间内，凭缴费凭证和受理回执到办证大厅领取通行证。
注意：办理通行证的具体流程和所需材料可能因个人情况和通行证类型而有所不同，建议在办理前详细咨询相关部门。