根据深圳市的交通限行政策，以下是在深圳申请不限行通行证的步骤：
1. 准备材料：需要提供身份证、驾驶证、行驶证、车辆合格证、单位组织机构代码证（或营业执照）等材料的原件及复印件。
2. 填写申请表：在深圳市交警局网站下载并填写《深圳市限行区域通行证申请表》。
3. 提交申请：将准备好的材料提交到深圳市交警支队车管所，或者通过邮政代办服务进行申请。
4. 审核审批：交警部门会对提交的申请进行审核，符合条件的，会核发深圳市限行区域通行证。
5. 领取通行证：可以通过邮政代办服务获取通行证，也可以通过市交警支队车管所现场领取。
需要注意的是，并非所有车辆都可以申请不限行通行证。只有符合以下条件之一的车辆才可以申请：
- 车辆属于本市核发的残疾人专用车、邮政车、救护车、工程救险车； - 车辆属于持有本市户籍的居民名下第一辆私家车； - 车辆属于持有有效居住证的非本市户籍人员名下第一辆私家车； - 车辆属于持有有效工作类、商务类深圳市居住证的人员名下车辆。
此外，申请不限行通行证的车辆还需要定期接受检验，违反限行规定仍然会受到处罚。