根据《中华人民共和国道路交通安全法》的规定，车辆违反限行规定的，公安机关交通管理部门会对违法车辆进行处罚。具体的处罚措施包括：
1. 罚款：通常罚款金额为200元。
2. 扣分：如果驾驶员的驾驶证累计积分未满12分，那么会被扣3分；如果已经满12分的，将会被扣留驾驶证，需要参加学习并通过科目一考试才能重新获得驾驶资格。
3. 拖移车辆：对于违反限行规定且无法当场提供驾驶证的车辆，交通管理部门有权将其拖移至指定地点。
需要注意的是，各地的限行规定和处罚标准可能会有所不同，具体请参考当地的相关规定。