根据公安部《机动车登记规定》第十六条的规定，已注册登记的机动车如需改变车身颜色，机动车所有人应当向登记地车辆管理所申请变更登记。具体步骤如下：
1. 准备所需材料：车主身份证、行驶证、机动车登记证书等。
2. 前往车管所办理手续：携带相关材料到车管所服务窗口提交申请，填写《机动车变更登记申请表》。
3. 缴纳费用：根据当地政策，可能需要缴纳一定的工本费。
4. 等待审核：车管所对提交的材料进行审核，审核通过后，车主需要在变更后十日内完成车身颜色的更改。
5. 完成车身颜色更改：按照车管所的要求，到指定的车辆维修企业进行车身颜色的更改。
6. 复查：更改完成后，车主需要返回车管所进行复查，确保符合规定。
请注意，不同地区的具体流程可能略有差异，建议提前咨询当地车管所了解详细信息。