当您的车辆因涉水行驶或被水淹导致发动机损坏时，您可以按照以下步骤向保险公司申请赔偿：
1. 立即报警：在水淹事故发生后，您应立即拨打交警报警电话，说明事故发生的情况，并获取出警记录。这将有助于您在后续理赔过程中提供证据。
2. 拍照留证：在现场，您需要拍摄车辆被水淹的照片，包括车辆位置、周围环境和车辆内部情况。这些照片将作为证明车辆受损程度的重要证据。
3. 联系保险公司：尽快联系您的保险公司，报告事故并进行现场查勘。保险公司将根据您购买的保险类型（如车辆损失险、涉水险等）来判断是否予以赔偿。
4. 提交相关材料：根据保险公司的要求，您需要提供相关证明材料，如驾驶证、行驶证、出警记录、照片等。材料齐全且符合要求的情况下，保险公司将开始进行理赔流程。
5. 评估损失：保险公司会根据车辆受损情况进行评估，确定维修费用或车辆残值。如果车辆无法修复，保险公司可能会考虑赔付车辆残值；如果车辆可以修复，保险公司将支付维修费用。
6. 领取赔偿：在理赔流程完成后，您可以根据保险公司的指示领取相应的赔偿款项。请注意，不同保险公司的理赔流程和标准可能有所不同，具体操作请遵循保险公司的规定。