代收车船税的入账方式如下：
1. 首先，收到车主支付的车船税时，应开具正规的发票或收据给车主。这可以作为收款凭证。
2. 然后，将收到的车船税存入指定的车船税专户，如税务部门指定的专户。这样可以确保税款能够按照规定用于相应的支出。
3. 在记账时，根据收到的发票或收据，借记“现金”或“银行存款”科目，贷记“应交税费——车船税”科目。待缴纳税款时，借记“应交税费——车船税”科目，贷记“现金”或“银行存款”科目。
4. 最后，将缴纳的税款记录在“应交税费——车船税”科目的借方，表示已经缴纳的税款；同时，在“车船税专户”科目的贷方记录缴纳的税款金额，表示车船税专户的余额。