在船舶发动机中，通常使用四冲程发动机。这是因为四冲程发动机比二冲程发动机更可靠、更高效且更环保。
四冲程发动机的工作原理是：进气、压缩、燃烧、排气四个阶段。每个工作循环包括两个上止点和两个下止点。这种设计使得燃油和空气可以更充分地混合，从而提高燃烧效率并减少排放。此外，四冲程发动机的平衡性更好，振动较小，使用寿命更长。
相比之下，二冲程发动机的工作原理是：进气、压缩、燃烧、排气三个阶段。由于二冲程发动机在每个工作循环中只有一个上止点，因此燃油和空气的混合不如四冲程发动机充分。这可能导致燃烧效率较低，排放较高，且发动机的振动较大。
总的来说，虽然二冲程发动机在某些特定应用中可能更具优势（如轻型船舶或娱乐船只），但在船舶行业中最常用的仍然是四冲程发动机。