在进行单位车辆的年检时，需要准备以下手续：
1. 《机动车检验标志申请表》：填写车辆基本信息和申请人的相关信息。
2. 机动车行驶证：原件复印件均需准备，用于证明车辆的基本信息。
3. 机动车交通事故责任强制保险凭证：原件复印件均需准备，证明车辆已购买交强险。
4. 车船税纳税或者免税证明：原件复印件均需准备，证明车辆已缴纳车船税。
5. 车主身份证明：原件复印件均需准备，证明车主的身份信息。
6. 委托他人办理的需要提供委托书和代办人的身份证明：原件复印件均需准备，如果车主无法亲自办理，可以委托他人代办。
准备好以上材料后，将它们提交给当地的车管所或者指定的检测站，按照工作人员的指引完成年检流程。