重大事故的调查通常由多个机构或组织共同进行，包括政府部门、独立监管机构和专门的调查委员会。具体负责调查的机构可能因事故的类型和规模而异。
例如，在核能领域，国际原子能机构（IAEA）通常会参与核事故的调查。在美国，核事故调查通常由美国核管会（NRC）负责。对于航空事故，各国通常设有独立的航空安全机构，如美国的国家运输安全委员会（NTSB），来负责调查事故原因并提出改进措施。
在化工事故中，通常由环保部门、安全生产监督管理部门等负责调查。
总的来说，重大事故调查的责任主体通常是具有专业知识和权威性的政府或行业监管部门。