当驾驶员的驾照分数被一次性扣除12分时，意味着驾驶员的行为已经严重违反了交通法规。在这种情况下，驾驶员需要采取以下措施来处理：
1. 学习并参加科目一考试：驾驶员需要在收到扣分通知后的一个月内，到当地的交通管理部门报名参加为期七天的道路交通安全法律、法规和相关知识学习。完成学习后，还需要通过相关科目的考试（即科目一）。
2. 重新获取驾驶资格：在完成科目一考试并通过后，驾驶员可以重新获得驾驶资格。在此之后，驾驶员应严格遵守交通法规，确保不再发生违规行为。
3. 保持警惕和注意：驾驶员在重新获得驾驶资格后，应该更加关注自己的驾驶行为，遵守交通规则，避免再次出现违规行为。
4. 如果对处罚有异议，可以申请行政复议或行政诉讼：如果驾驶员认为扣分处罚不合理或不公正，可以向作出处罚决定的机关申请行政复议，或者向人民法院提起行政诉讼。但需要注意的是，这通常需要一定的法律知识和时间成本。